该剧情发生在凌晨三点的日本，故事主要围绕一位年轻女孩展开。她经常无法入眠并被神秘的力量拖向电脑前。在网上搜索时，她无意中发现了一个名为《凌晨三点》的恐怖视频。迷失其中的她陷入了一段涉及死亡和超自然事件的诡异旅程。她开始独立调查这个网站，却逐渐揭开了背后隐藏的真相：这个恐怖视频竟是由某个阴谋组织编排，并以特定时间点汲取观看者灵魂能量。女孩开始与其他受害者联络，并决心揭露组织并扫荡幕后黑手。（注：《凌晨三点日本无吗》并没有具体定义和解释，“无吗”仅为典型网络用语）