《御神乐学园组曲》是一部讲述青少年进入神秘的御神乐学园展开冒险的故事。主人公小翔在一次偶然中发现了可以召唤出强大战斗力的神器，于是他和三位好友悄然前往御神乐学园寻找更多的线索。在这里，他们遇到了众多巧妙设计的试炼以及各式各样的鬼怪对手。随着剧情逐渐推进，小翔等人不断提高自己实力，并且揭示出一个隐藏在学园背后真相——关乎整个世界命运的秘密。