《剧场版 艾斯奥特曼：大蚁超兽对奥特兄弟》的故事发生在一个和平的地球上。艾斯奥特曼与他的兄弟们，守护着人类的安全和幸福。然而，一只巨大而邪恶的蚁超兽突然出现，并开始袭击城市。面对这个强大的敌人，艾斯奥特曼和他的兄弟们展开了一场惊心动魄的战斗。同时，他们还必须解决内部矛盾并团结起来才能取得胜利。在战斗中，他们发现大蚁超兽是由某个神秘势力操控，并最终揭露了幕后黑手。最终，艾斯奥特曼与他的兄弟联手击败了大蚁超兽，并守护住了地球和人类安全。