小明在神秘的古书店遇到了一把有着魔力的笔。每当他使用它时，笔会变成一匹可爱的马娘，并赋予他们不可思议的绘画能力。小明与马娘们组成了"神笔马娘团队"，利用他们的绘画才能帮助人们解决问题和捍卫正义。然而，一个邪恶势力也发现了这个秘密，并企图夺取这支神奇的笔！小明和马娘们将面临重重困难和挑战，同时必须保护好他们拥有的珍贵力量。剧情充满奇幻元素、友情和冒险精神。