《东方三侠2》讲述了神秘邪教组织妖月教的复活，为图谋世界统治而展开的一系列阴谋。东方三侠决心毁灭该邪教，与妖月武僧、恶名昭彰的黑暗剑客斗智斗勇。在艰苦卓越的战斗中，他们结伴闯入神秘阵地并面对致命考验，最终揭示了一个惊天秘密。同时，在势力范围不断扩大的情况下，三人必须超越自我限制、逐步提升实力，并面对内心矛盾和挣扎。经过血战与牺牲，东方三侠成功击败妖月教主，并守护着和平安定的江湖。