在《军曹大电影3：克罗罗对克罗罗 天空大决战》，主人公军曹发现神秘的外星舰队即将入侵地球，威胁到全人类生存。为了保护家园，他招募并训练一支特别小队"克罗罗"，由不同国家的超级英雄组成。然而，在进行准备时，意想不到的事情发生了！一个叫做“克羅羅”的恶势力竟然自称是正义之师 ，由此展开了一场超能力之间斗争搏杀。最后，在天空中爆发激烈的战斗，军曹及其小队与“克羅羅”进行殊死搏斗，并成功击败敌人，守卫了世界和平。