《代号九耳犬》讲述了一名特工受命调查一起神秘失踪案件的故事。在追寻线索的过程中，他偶遇一只能够说人话的聪明补间“九耳犬”，并与其结成伙伴。他们合力解决种种难题，揭开了一个巨大的阴谋网络。最终，两者之间建立了深厚的友谊，并成功将罪犯绳之以法。整个剧情充满悬念和紧张感，同时呈现出对于勇气、智慧和友爱精神的赞颂。