《蓝色档案》讲述了一个神秘组织“蓝色”追踪调查犯罪分子的故事。主人公李晴是该组织一名出众特工，她接到了一起离奇杀人案的任务。在调查过程中，李晴发现这个案件与自己年少时期失散多年的亲妹妹有关，并被卷入了一个隐藏着深刻阴谋的复仇计划中。通过调动各种资源和实力，以及精彩激烈的战斗场面，李晴最终成功解开了谜团，揭示出惊天大阴谋并改写了命运。