《清宫秘档》讲述了咸丰皇帝驾崩后，他留下的遗书引发的一系列阴谋和争斗。主角是一个身世不明的女子，在得到一本古籍后踏入了这场权力之争。她与皇室成员、权臣和贵族们展开较量，揭示出隐藏在宫廷背后的真相。同时，她也渐渐发现自己与皇帝有着神秘联系，并探寻背后隐秘的历史。剧情扑朔迷离、充满紧张刺激，同时也透露出深刻人性哲理和关于爱情、背叛、友谊和勇气等主题的思考。