在一次高中生联谊活动后，主人公柯南遇到了一个言行怪异的男子。随着调查的深入，柯南发现这名男子是来自黑衣组织的成员，并追踪他来到一处废弃工厂。在那里，柯南独自面对黑衣组织老大并揭穿了他诡计。然而，在危机关头，灰原哀和小兰也受到威胁。最终，柯南巧妙地利用聪明才智解救了众人，并成功将警察局送达现场逮捕了黑衣组织成员。