第二季《某科学的超电磁炮》继续讲述了学园都市中的超能力少女御坂美琴与她身边众多同伴们的冒险故事。新一波神秘怪物入侵学园都市，威胁到整个城市的安全。为了保护自己和朋友，美琴面对重重危机挑战，不断突破自我成长。同时，她也逐渐发现隐藏在背后邪恶实验计划的真相，并致力于揭露黑暗势力的阴谋。这一季将带领观众进入更深层次、刺激且紧张万分的故事情节之中。