故事发生在《神秘世界历险记2》之后，主人公鲍勃和艾丽丝被一封古老的信件引诱到了一个神秘的岛屿。他们发现这是一个充满魔法与传奇的地方，而岛上隐藏着一颗能够赋予永生力量的神奇宝石。然而，恶势力欲将其据为己有。在获得新伙伴小精灵帮助下，他们决定保护宝石并阻止邪恶计划。在探索中，他们解开了许多谜题、遭遇各种陷阱与怪物，并最终通过团队合作和勇气击败了邪恶势力。故事结局留下悬念，预示着更大、更惊险的旅程即将开始。