《星辰变第二季》讲述主人公们在星际战争后的复兴与冒险故事。外星势力再度入侵地球，人类开始筹组中央联盟，在宇宙基地集结力量迎接来敌。年轻的舰长率领飞船小队踏上探索未知恒星系的旅程，无意间发现了一个神秘文明图谱，为地球带来新转机。众英雄面临各自内心挣扎和成长，同时直面他们逐渐浮出水面、觊觎图谱之邪恶势力。斗智斗勇之余，他们达成协议并用真情护佑着一股正义力量，最终战胜邪恶回到家园，展开全新篇章。