《腹黑妹妹控兄记》是一部描写虽表面上照顾弟弟的可爱妹妹实则心计深沉、懂得利用各种手段巧妙调皮捣蛋的故事。主人公小宝在家里被众人宠爱，却不料发现自己无时无刻都处在小妹云雀恶作剧的目标下。然而，每当小宝陷入困境时，小妹总会灵活运用她天才级智商和腹黑本色帮助哥哥化险为夷。二人之间渐生感情纠葛，在欢乐与思念中共同成长。