故事发生在一所普通高中，主人公小明是个体格强壮的体育生。他因为优秀的身体素质而备受关注，被同学暱称为“种马”。然而，富二代王子却嫉妒小明的魅力和倾慕者。在校园偶像争霸赛上，王子找来人恶整了小明。无意中，小明得到一位华丽神秘女孩的帮助，并将其真实身份误认为魔法少女。两人展开合作、逐渐接近，在荣誉与友情中成长。最终，他们拆穿了王子恶行并收获胜利与幸福。《高中种马体育生》不仅描写了青春期学生间友谊和勇气争斗的故事，也探讨了追求自我价值和培养共同目标的重要性。