在剧情简介中，越狱第五季继续展现主角迈克尔·斯科菲尔（Michael Scofield）的生存奇遇。迈克尔被发现并关押在一个秘密监狱中，他必须寻找办法逃脱，并解释为何他还活着。同时，在外部，极其心怀恶意的敌人正在暗地里策划着更大规模的阴谋。迈克尔联合其他原来越狱的成员再度组成团队，使用他们各自拥有的技能和资源，与时间赛跑以揭示真相并保护自己及亲友不受威胁。