名侦探柯南：漆黑的追踪者在一次连环杀人案件中，柯南遇上了一个神秘而残忍的杀手。这个杀手以漆黑的外貌和高超的技巧闻名，总是在夜晚袭击受害者。柯南与小兰展开了调查，并发现所有受害者似乎都与过去一个经济犯罪集团有关。在跟进线索时，他们遇到了一位同样为正义发声的年轻女性记者，并联手寻找真相。当他们逐渐接近杀手时，不料却发现恐怖阴谋背后隐藏着更大的惊天秘密，让整个案件变得更加扑朔迷离，警察无法信任、国家保密部门卷入其中。于是柯南必须运用自己聪明才智化解这场困局，并揭露幕后黑手！