日本研究机构神秘失灵，导致人们身上突然出现奇特标记。检察官决定调查案件，揭示背后的真相。他与一个名叫“世间”的组织联手，发现标记可以转化成能量并赋予超能力。为了保护人类免受恶势力侵袭，“世间”将寻找合适者成为假面骑士圣刃。年轻勇敢的青年选中，并通过仪式获得变身装置和剑盾武器，成为圣刃。“世间”与邪恶势力展开精彩战斗，拯救城市免受威胁。同时，主角也在对抗中发掘自己潜能和内心力量的故事开始了。