第一季结局中，医妃云容凤（袁美云饰）与青梅竹马的少年皇帝安陵玥（张钧甯饰）终于走到了一起。在第二季中，他们面临着新的挑战。国内外势力企图破坏两人之间稳定的关系，并试图夺取朝廷权力。为了保护自己和皇室，云容凤开始修习更高深神秘的医术，并获得神秘老师指点。同时，她也发现了邪恶势力背后隐藏着惊天阴谋。为了拯救国家与爱情，云容凤将和安陵玥一同展开壮烈卓越的冒险旅程。