《星际传奇3》发生在未来的宇宙，故事主要围绕着一位无名战士展开。银河系正陷入混乱之中，因为邪恶帝国试图统治整个宇宙。在激烈的战斗中，主角与一支反抗势力联合起来，共同对抗帝国的暴政。他们经历了一连串惊心动魄的空间战斗和刺激的冒险，最终成功挑衅帝国的霸权，并为自由和和平建立了新秩序。然而，在取得胜利后，主角不幸牺牲，但他为了所有人民争取到了真正意义上的自由。