《蓝色档案》是一部悬疑剧，讲述年轻警官Alex在调查一起神秘失踪案件时发现了一个名为“蓝色档案”的秘密组织。随着调查的深入，Alex逐渐揭开了“蓝色档案”背后的巨大阴谋：该组织利用黑科技控制人类思想，并试图统治世界。面对敢于抵抗的Alex，组织展开了残酷追捕。同时，他结识了神秘女子Jade，两人共同努力揭露真相、打败恶势力，最后成功解救出所有被控制的人们，并将“蓝色档案”交给公众保管。