在《进击的巨人88》中，以艾伦为首的调查兵团继续与巨人战斗。他们发现了一个由巨大树木构成、高耸入云的岛屿“蜥蜴之岛”。艾伦等人进入其中，探索隐藏的秘密。他们遇到了操纵巨人能力的玛雷家族，并得知历代国王握有并使用着“始祖之力”的魔力。然而，前任对此负责使命感烙印深刻欲死不散。为了夺回自由，艾伦决心揭示邪恶势力背后真相。随着剧情推进，新更大型的巨人出现令一场激烈战役即将展开……